两年后，他敬爱的老师陈子龙被俘，自尽于松江之水。孤独的夏完淳没有选择停下，或者像那个时代的大多数人一样选择逃避，而是继续在山间作战。
最终，他写给鲁王的奏折被清人截获，地址泄露，他很快被捕，押送南京——沿着老师的道路。他路过一片山间树林，那里离老师自尽的地方很近了，他终于压抑不住自己的情感，痛哭起来，写下一首《细林野哭》，悼念自己的老师。他回忆“去年平陵鼓声死，与公同渡吴江水”，我们一起渡河作战，“今年梦断九峰云，旌旗犹映暮山紫”，此刻血染的旌旗还在，老师却不在了。“黄鹄欲举六翮折，茫茫四海将安归？”四海之大，我又将去往何处？“肠断当年国士恩，剪纸招魂为公哭”，他为老师招魂，也为故国招魂。
在南京，洪承畴亲自审讯他。洪承畴本是明朝的三边总督，后在松山之战后降清，作为急先锋，南下江南。洪承畴见他是个少年，动了恻隐之心，有意保他一命，说：“这是个年幼无知的孩童，哪里懂造反，估计是被人蛊惑了。归顺大清吧，在我部下做官。”夏完淳故意问“你是何人”，当旁人告诉他这就是大名鼎鼎、威震四海的洪承畴时，夏完淳大声说：“洪承畴大人战死沙场，名垂千古，先帝亲自祭奠他，此人一定是假冒的！”洪承畴羞愧难当，挥手命人杀掉夏完淳。
当时，夏完淳的岳父钱栴也在现场，他也是一位正直的士大夫。生死关头，他面色如灰，垂头丧气。完淳回头，笑着对他说：“当日，您、子龙先生和我一起歃血，现在我们慷慨同死，一起去见陈先生，不也是大丈夫吗？”
钱栴点点头，于是二人一起被杀。
这是他对岳父说的最后一句话。写到这里，忽然想起夏完淳初见岳父说的第一句话，那时，他还是个九岁的孩子。他问钱栴：“时局如此，不知您在研读何书？究心何事？”钱栴大吃一惊，不知如何回答，只好说：“是和令尊大人一样啊。”
夏完淳在最后的日子里，写下一些与这个世界告别的文字。比如那首告别故乡的《别云间》：“三年羁旅客，今日又南冠。无限山河泪，谁言天地宽。已知泉路近，欲别故乡难。毅魄归来日，灵旗空际看。”他爱故乡，却至死不忘复仇，即使魂魄归乡，也要带领大明的军队收复江南。
他在狱中写给母亲的书信，则流露出更多的悲伤和无奈，更符合他的年龄。他说：“慈君托迹于空门，生母寄生于别姓，一门漂泊，生不得相依，死不得相问，淳一死不足惜，哀哀八口，何以为生？”他想到自己死后，母亲和家人寄人篱下，无以为生，不禁怆然。然而，他咬咬牙，说：“二十年后，淳且与先文忠（允彝）为北塞之举矣！勿悲勿悲！”他告诉母亲，不要悲伤，二十年之后，他将和父亲一起，继续北伐，最后，他回忆自己短暂的一生，说：“噩梦十七年，报仇在来世。神游天地间，可以无愧矣！”他也写了一封寄给妻子的信，虽然八岁便与这个叫钱秦篆的女孩订婚，却只陪她过了三个月的婚姻生活，便投身沙场。写这封信的时候，一贯坚强的他，情绪几乎失控：“肝肠寸寸断，执笔辛酸，对纸泪滴；欲画则一字俱无，欲言则万般难吐。吾死矣，吾死矣！方寸已乱。平生为他人指画了了，今日为夫人一思究竟，便如乱丝积麻。身后之事，一听裁断，我不能道一语也。停笔欲绝。吾累汝，吾误汝，复何言哉！”他像一个孩子一样，喃喃自语“吾死矣，吾死矣！方寸已乱”，作为一个丈夫，他只能用“吾累汝，吾误汝，复何言哉”来表达自己的歉意。
这是个有血有肉的夏完淳。
他本来可以从一个神童，成长为一个风度翩翩的江南才子，像唐伯虎一样遨游山水、诗酒生涯，也可能高中进士，像他的父亲一样，做一名优秀的朝廷官吏。
然而，这个匆忙的乱世，没有给他太多的时间和空间。
其实，陈子龙、夏完淳不仅是为明朝殉难，更是为自己心中的志向、坚守的文化殉难。
这个倔强而深情的少年，是松江之上、东海之畔的一只鸟——精卫鸟。